腸胃道疾病是一個多因子的疾病，除了基因及生活習慣之外，環境因子更不能輕忽！環境因子的危害對「微生態」系統的破壞力不容忽視，民眾要重視環境因子造成的危害，不亞於基因及生活習慣的影響，才能讓腸胃道健康更全面性。

幽門螺旋桿菌療法日新月異，高除菌率為治療的最主要目標，目前台灣醫師發明的最新「高劑量小餐包療法（BAP）」，只使用單一抗生素，除菌率達98%、且低副作用，期望未來可能成為治療幽門螺旋桿菌的重要方法，達到根除幽門螺旋桿菌感染，讓胃癌絕跡的目標。

台灣針對C型肝炎（Hepatitis C）的治療及研究，從30幾年前便已經開始展開，雖然相較歐美各國，台灣的感染率並未太高，落在約1～5%之間，但歷經數十年的研究，C型肝炎的治療終於迎來最後一里路，它的機遇與挑戰也備受學界注目。

胃食道逆流已成為現代人的文明病之一，根據台大醫院健康管理中心統計，來健檢的民眾中，2003～2006年間只有15.7%看到逆流性食道炎，但2019年的統計已經高達35%，等於每3個人就有1個。早年通常以藥物治療，到了近10年發展出新術式，使得受胃食道逆流影響的壓力世代，能在症狀上獲得有效的舒緩。

早在2015年左右，高醫大便是台灣第一個進行腸道微菌叢植入治療（Fecal microbiota transplantation, FMT）研究的團隊。團隊之一，目前是高醫岡山醫院院長的吳登強解釋，FMT就是俗稱的「糞便療法」，透過捐贈者的糞便，在經過生理食鹽水稀釋、過濾雜質，取出微菌叢，再進行植入治療。然而，考量還殘留部分異味，醫師大多採取大腸鏡、鼻胃管、胃鏡等方式進入腸道，盡量不靠近胃部區段。吳登強分享自己的臨床經驗，從上面（口腔）走，即使導管放得很深，但還是有部分會跑到胃，旁邊人聞到大便味會很不舒服；而且從上面灌，太多還會嗆到的糗事。